淡海輕軌營運時間為06:00~24:00，重疊區(紅樹林站-濱海沙崙站)班距尖峰5-7分鐘、離峰約10分鐘一班車；非重疊區(崁頂站-淡海新市鎮站及淡水漁人碼頭站-台北海洋大學站)班距尖峰6-12分鐘、離峰20分鐘，並將視實際搭乘情形調整班距，假日重疊區(紅樹林站-濱海沙崙站)班距為10-15分鐘，非重疊區則為20-30分鐘。
詳細請見時刻表。
本公司將持續觀察旅客乘車流量，適時公告調整營運時間與列車班距。